Горец перечный обладает кровоостанавливающим, обезболивающим, противовоспалительным, успокаивающим и антисептическим свойствами. Кровоостанавливающее действие у них сочетается со способностью стимулировать сокращение мышц матки подобно такой способности спорыньи, но у препаратов  Горец перечный это свойство оказывается значительно слабее.

В научной медицине препараты Горец перечный используют в основном как кровоостанавливающее средство при маточных кровотечениях на почве гипотонии матки в результате воспалений, при полименорее разного генеза, при небольших геморроидальных кровотечениях, при кровотечениях из мелких сосудов и капилляров желудка и кишок.

Чаще их используют в качестве вспомогательного средства в комплексной терапии при маточных и внутренних кровотечениях. В сочетании с другими лекарственными растениями горчицу перечный используют при поносах и энтероколитах.